Los pacientes que presentan un absceso perianal recurrente, o un orificio que drena en forma constante o intermitente en la región perianal, deben ser considerados para tratamiento quirúrgico a fin de curar la fístula perianal. Así, la meta de la cirugía es erradicar la fístula con una fistulotomía o una fistulectomía, la que resulte en la más baja tasa de recurrencia, con el menor impacto en la continencia, en el intervalo de tiempo más corto.